Rytų Europos studijų centro valdybą sudaro:
- Vilniaus universiteto Tarptautinių santykių ir politikos mokslų instituto lektorius Vytis Jurkonis (Valdybos pirmininkas);
- Lietuvos Respublikos Prezidento patarėja Skirmantė Straigienė;
- Lietuvos Respublikos užsienio reikalų ministerijos Strateginių sprendimų paramos grupės vadovė Lina Rukštelienė;
- Lietuvos Respublikos Krašto apsaugos ministerijos Politikos direktorius Vaidotas Urbelis;
- Lietuvos Respublikos Ministrės Pirmininkės patarėja Galina Vaščenkaitė;
- Lietuvos Respublikos Seimo Nacionalinio saugumo ir gynybos komiteto biuro patarėjas Nortautas Statkus;
- Rytų Europos studijų centro direktorius Linas Kojala (ex officio).
Rytų Europos studijų centro Patarėjų tarybą sudaro:
- Andrius Kubilius (pirmininkas)
- Gintė Damušis
- Rasa Juknevičienė
- Raimundas Karoblis
- Linas Linkevičius
- Gintautas Mažeikis
- Kęstutis Macijauskas
- Petras Vaitiekūnas
- Mindaugas Jurkynas
- Dovilė Jakniūnaitė
- Algimantas Rimkūnas
- Agnia Grigas
- Asta Maskaliūnaitė
- Janina Šleivytė
- Živilė Dambrauskaitė
- Albinas Januška
- Gediminas Kirkilas
- Antanas Valionis
- Milda Matačiūnaitė-Boyce
- Paulius Gritėnas
- Petras Auštrevičius
- Vladimiras Jarmolenko